Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD12P35452 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms