Protein–RNA interactions for Protein: P35125

USP6, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP6P35125 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP6P35125 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP6P35125 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP6P35125 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
USP6P35125 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
USP6P35125 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
USP6P35125 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
USP6P35125 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
USP6P35125 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
USP6P35125 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
USP6P35125 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms