Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC12P31275 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC12P31275 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms