Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
TSPOP30536 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
TSPOP30536 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
TSPOP30536 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
TSPOP30536 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms