Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MARCKSP29966 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms