Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LOXP28300 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LOXP28300 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LOXP28300 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LOXP28300 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms