Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNCP24821 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNCP24821 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNCP24821 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNCP24821 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms