Protein–RNA interactions for Protein: P22694

PRKACB, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACBP22694 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRKACBP22694 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms