Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NF1P21359 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NF1P21359 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NF1P21359 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NF1P21359 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NF1P21359 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NF1P21359 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NF1P21359 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NF1P21359 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms