Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK11BP21127 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK11BP21127 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms