Protein–RNA interactions for Protein: P20749

BCL3, B-cell lymphoma 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL3P20749 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
BCL3P20749 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
BCL3P20749 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BCL3P20749 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms