Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LMNB1P20700 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms