Protein–RNA interactions for Protein: P17096

HMGA1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGA1P17096 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HMGA1P17096 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HMGA1P17096 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms