Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM27P14373 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms