Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC5A1P13866 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC5A1P13866 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms