Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
COL6A2P12110 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL6A2P12110 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL6A2P12110 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL6A2P12110 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL6A2P12110 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL6A2P12110 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL6A2P12110 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL6A2P12110 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL6A2P12110 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL6A2P12110 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms