Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HKR1P10072 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HKR1P10072 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HKR1P10072 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HKR1P10072 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HKR1P10072 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HKR1P10072 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HKR1P10072 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HKR1P10072 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms