Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
IGHV1-8P0DP01 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms