Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC192P0DO97 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms