Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
TMIGD3P0DMS9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TMIGD3P0DMS9 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms