Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M3

SFTA3, Surfactant-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA3P0C7M3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SFTA3P0C7M3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTA3P0C7M3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms