Protein–RNA interactions for Protein: P0C2S0

CTXN2, Cortexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN2P0C2S0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTXN2P0C2S0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms