Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PTPRCP08575 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTPRCP08575 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
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