Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR3DP05423 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms