Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFNA2P01563 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms