Protein–RNA interactions for Protein: O75822

EIF3J, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit J, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3JO75822 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
EIF3JO75822 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.2 ms