Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RPS6KA4O75676 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KA4O75676 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms