Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CREB3O43889 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CREB3O43889 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CREB3O43889 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CREB3O43889 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CREB3O43889 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CREB3O43889 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CREB3O43889 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms