Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
SYNGR3O43761 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SYNGR3O43761 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms