Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CYTH3O43739 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CYTH3O43739 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms