Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HTRA2O43464 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HTRA2O43464 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms