Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MEFVO15553 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MEFVO15553 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MEFVO15553 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MEFVO15553 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MEFVO15553 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MEFVO15553 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MEFVO15553 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MEFVO15553 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MEFVO15553 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MEFVO15553 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
MEFVO15553 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
MEFVO15553 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms