Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VGFO15240 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VGFO15240 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VGFO15240 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VGFO15240 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VGFO15240 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VGFO15240 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VGFO15240 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VGFO15240 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VGFO15240 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VGFO15240 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
VGFO15240 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VGFO15240 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VGFO15240 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VGFO15240 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VGFO15240 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VGFO15240 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VGFO15240 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VGFO15240 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VGFO15240 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VGFO15240 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
VGFO15240 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
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