Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFIT3O14879 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFIT3O14879 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms