Protein–RNA interactions for Protein: O00472

ELL2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL2O00472 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ELL2O00472 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ELL2O00472 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ELL2O00472 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ELL2O00472 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ELL2O00472 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ELL2O00472 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ELL2O00472 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
ELL2O00472 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ELL2O00472 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ELL2O00472 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ELL2O00472 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ELL2O00472 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ELL2O00472 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms