Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
APOC4-APOC2K7ER74 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
APOC4-APOC2K7ER74 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms