Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms