Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NPIPB9F8W1W9 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NPIPB9F8W1W9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms