Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
E9PCH4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
E9PCH4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
E9PCH4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
E9PCH4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
E9PCH4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
E9PCH4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
E9PCH4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms