Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SRRM5B3KS81 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SRRM5B3KS81 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms