Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC69A6NI79 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms