Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HELTA6NFD8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms