Protein–RNA interactions for Protein: A1L4H1

SSC5D, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSC5DA1L4H1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SSC5DA1L4H1 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSC5DA1L4H1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSC5DA1L4H1 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSC5DA1L4H1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSC5DA1L4H1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSC5DA1L4H1 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSC5DA1L4H1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SSC5DA1L4H1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SSC5DA1L4H1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms