Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
IRGMA1A4Y4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
IRGMA1A4Y4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms