Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
E2F8A0AVK6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms