Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC243756.1-201ENST00000584068 660 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TOP3AQ13472 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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