Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 OR8H1-203ENST00000641600 2927 ntAPPRIS P2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TROVE2-205ENST00000367446 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MAPK10-366ENST00000641903 2812 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CDY18P-201ENST00000438294 1609 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 NXT2-203ENST00000372106 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AQP4-AS1-201ENST00000568797 3119 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PLS3-202ENST00000355899 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 FHL1-216ENST00000535737 2325 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC003973.2-201ENST00000596778 1394 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CDY2A-202ENST00000426790 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CDY2B-202ENST00000544303 2369 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TRIM16-212ENST00000578237 3206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL031656.1-202ENST00000457704 1995 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SYNE1-213ENST00000448038 6001 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MUM1L1-201ENST00000337685 4308 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 COL6A4P1-202ENST00000487147 4317 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CCDC129-205ENST00000451887 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ZADH2-202ENST00000537114 3205 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CRBN-203ENST00000432408 2203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RABGEF1-202ENST00000380828 3864 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 TMEM209-206ENST00000473456 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PIAS1-201ENST00000249636 8115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PKIA-AS1-202ENST00000522302 2011 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 DPPA4-201ENST00000335658 2817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ESRP1-201ENST00000358397 3756 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 UBR1-202ENST00000546274 3332 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC109481.1-201ENST00000509173 282 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 IGHV7-34-1-201ENST00000519200 350 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PSMA6-214ENST00000556506 763 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MZT1P2-201ENST00000604387 248 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 LSM8-204ENST00000424702 4030 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 BMPR2-202ENST00000374580 11461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 BTK-209ENST00000618050 2417 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 ZNF182-202ENST00000396965 3586 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CPNE4-202ENST00000502818 2120 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CNOT4-201ENST00000315544 3783 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 BLOC1S2-206ENST00000618916 2470 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 PAIP1-202ENST00000338972 1814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
MKRN3Q13064 MKKS-201ENST00000347364 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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