Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MIMT1-201ENST00000597105 1050 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SRSF5Q13243 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms