Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 UBE2Q2P1-202ENST00000354771 883 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PCLAF-203ENST00000558008 766 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
CHAF1AQ13111 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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