Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 CEACAM5-203ENST00000405816 2354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 AC107983.2-201ENST00000425211 4735 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SPEF2-211ENST00000509059 4707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ZC3H8-202ENST00000409573 5965 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 SSX5-201ENST00000311798 1384 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 AC091806.1-201ENST00000452690 3000 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 XIST-206ENST00000434839 2865 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 RSF1-201ENST00000308488 11550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 LINC00683-202ENST00000579781 3510 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FOXC1Q12948 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 ERVFRD-1-202ENST00000542862 3184 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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FOXC1Q12948 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 AL136985.3-201ENST00000637377 2219 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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FOXC1Q12948 NRXN3-207ENST00000554719 4156 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-1017P-201ENST00000363613 106 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FOXC1Q12948 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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